第1話 「友よ静かに眠れ−前編」
新エネルギー資源の開発で世界的に注目される科学者・倉科（浜田学）が殺害された。
倉科は、銭形（鈴木亮平）の大学時代の先輩だった。大切な先輩を殺した
犯人逮捕のため、銭形は捜査一課の管理官・城ケ崎（渡辺いっけい）に捜査への
参加を懇願し、国木田（三浦貴大）とともに捜査を始める。
捜査を進めるうちに、倉科の恋人・未季（芦名星）につきまとっていた
高杉（和泉崇司）という男が容疑者として浮上。
同じころ、警視庁公安部外事特務課の阿部（渡部篤郎）もこの事件を内偵捜査していた…。
次々と発見される証拠から、捜査本部では高杉を犯人と断定。
銭形をはじめ全捜査員投入によりついに高杉を発見、
しかし逃亡しようとした高杉がトラックにはねられて死亡。
犯人逮捕を目前にして被疑者死亡で捜査は終了、
捜査本部も解散になってしまう。
そんな中、納得のいかない銭形はこれまでの捜査資料から一つの矛盾にたどりつき、
ある大きな行動に出るのだった…！
- ある美術館から名画が盗まれた。犯行現場には「お宝はいただいた」というルパン三世からのメッセージが残され、警備員の遺体が発見される。ルパン三世逮捕に意気込む警視庁の刑事たちの前に、ルパンを追い続ける警視庁国際捜査課の銭形（鈴木亮平）が現れる。銭形は、この事件の犯人がルパンではないと断言し、警視庁捜査一課の夏希（前田敦子）、国木田（三浦貴大）とともに独自の捜査を開始。銭形ならではの地道な現場検証を行って真犯人を突き止めていく。そんな銭形の捜査方法に、夏希と国木田は振り回されるばかり。その後、警視庁捜査一課に“Ｍｒ．Ｑ”と書かれた人形とカードが届く。まもなく、ミスタークエスチョンと名乗る人物から電話がかかってくる。彼は「警察と知恵比べがしたい」と言い、クイズを出題。そのクイズの答え通りに、爆発事件が発生する。さらに、ミスタークエスチョンは、まだ東京のどこかに爆弾が仕掛けてあると宣言。銭形たちは、ミスタークエスチョンの出題するクイズに従って東京のあちこちに仕掛けられた爆弾の爆発阻止に奔走する…！
- 第1話 「凶弾から少女を守れ！」
民家で強盗殺人事件が発生！ 両親を射殺され、娘の沙羅（住田萌乃）だけが生き残った。 唯一の目撃者である沙羅は、警察に保護され入院することに。定期健診で病院を訪れていた銭形（鈴木亮平）は、少女を連れた夏希（前田敦子）と出くわす。その少女・沙羅は事件の被害者であり、心因性のショックによる失語状態になっていた。捜査が行き詰まる中、沙羅は両親を襲った黒服の男・加賀見（要潤）を発見する。自分の命を狙われていることに気づいた沙羅は、病室を抜け出し必死に逃げるが…。そんな中、院内の異変に気づいた銭形は沙羅の行方を捜すが、果たして残忍な強盗犯の魔手から守ることができるのか!?
